El proceso de descubrimiento de conocimiento de los datos (DCD), representa una valiosa herramienta para el análisis de la información. El presente trabajo presenta una aproximación a través del proceso DCD para la identificación de patrones ecosistémicos en series de tiempo de datos mensuales biológico-pesqueros de la pesquería de anchoveta y sardina en el norte de Chile. Con el uso de técnicas de análisis de series de tiempo, análisis multivariado y minería de datos se identifican patrones relevantes entre las variables que dan cuenta de fenómenos de caracter ecosistémico, estableciendo períodos en los cuales se identifican condiciones favorables/desfavorables a la anchoveta y períodos de aumento/disminución de sardina, con el fin de reducir brechas en la implementación de las políticas de adminstración pesquera nacional de dichas pesquerías.